研究室
HOME > 一般向けトップ > 研究室紹介 > イオン育種開発室 > 植物ゲノム進化研究チーム

原子核・元素変換研究部門

RIBF研究基盤部門

加速器応用研究部門

素粒子物性研究部門

仁科センター直下

植物ゲノム進化研究チーム

リーダーの写真
チームリーダー
阿部 知子Tomoko ABED.Agr.
  • 1989年東北大学大学院農学研究科農学専攻修了
    東北大学遺伝生態研究センター 遺伝子多様性研究部門 日本学術振興会特別研究員
  • 1990年理化学研究所 薬剤作用研究室 基礎科学特別研究員
  • 1991年同 研究員
  • 1993年同 植物機能研究室 研究員
  • 2006年同 仁科加速器研究センター加速器応用研究グループ生物照射チ−ム副チームリーダー
  • 2008年同 加速器応用研究室生物照射チーム チームリーダー
  • 2010年同 加速器応用研究室 室長

研究室プロフィール

重イオンビームを植物に照射し形態変異体を観察、変異誘発に最適なLETがあること、LETに依存して大欠失や染色体再構築が発生する割合が大きくなることを示しました。近年、微生物・植物研究でも、次世代シーケンサーの利用が一般的となり、ゲノム情報に基づいて変異解析を行う時代が到来しました。仁科加速器科学研究センターでは、世界に先駆けて加速器科学と農学の新たな学際研究として、重イオンビーム変異の特徴である欠失や染色体再構築といった変異ゲノムを微生物・植物研究に利用する Ion beam mutagenomics 研究領域を開拓します。

主要論文

  1. Kazama Y., Ishii K., Hirano T., Wakana T., Yamada M., Ohbu S., and Abe T.:
    “Different mutational function of low- and high-linear energy transfer heavy-ion irradiation demonstrated by whole genome re-sequencing of Arabidopsis mutants”
    Plant J. 92, 1020-1030 (2017)
  2. Ishii K., Kazama Y., Hirano T., Hamada M., Ono Y., Yamada M., and Abe T.:
    “AMAP: A pipeline for whole-genome mutation detection in Arabidopsis thaliana”
    Genes Genet. Syst. 91, 229-233 (2016)
  3. Kazama Y., Ishii K., Aonuma W., Ikeda T., Kawamoto H., Koizumi A., Filatov D.A., Chibalina M., Bergero R., Charlesworth D., Abe T., and Kawano S.:
    “A new physical mapping approach refines the sex-determining gene positions on the Silene latifolia Y-chromosome”
    Sci. Rep. 6,18917 (2016)
  4. Katano M., Takahashi K., Hirano T., Kazama Y., Abe T., Tsukaya H., and Ferjani A.:
    “Suppressor screen and phenotype analyses revealed an emerging role of the monofunctional peroxisomal enoyl-CoA hydratase 2 in compensated cell enlargement”
    Front. Plant. Sci. 7, 132 (2016)
  5. Yamada K, Suzuki H, Takeuchi T, Kazama Y, Mitra S, Abe T, Goda K, Suzuki K, and Iwata O.:
    “Efficient selective breeding of live oil-rich Euglena gracilis with fluorescence-activated cell sorting”
    Sci. Rep. 6, 26327 (2016)
  6. Hirano T., Kazama Y., Ishii K., Ohbu S., Shirakawa Y., and Abe T.:
    “Comprehensive identification of mutations induced by heavy‐ion beam irradiation in Arabidopsis thaliana”
    Plant J. 82, 93–104 (2015)
  7. Kazama Y., Fujiwara M.T., Takehisa H., Ohbu S., Saito H., Ichida H., Hayashi Y., and Abe T.:
    “Characterization of a heavy-ion induced white flower mutant of allotetraploid Nicotiana tabacum”
    Plant Cell Rep. 32, 11–19 (2013).
  8. Kazama Y., Nishihara K., Bergero R., Fujiwara M.T., Abe T., Charlesworth D., and Kawano S.:
    “SlWUS1; An X-linked Gene Having No Homologous Y-Linked Copy in Silene latifolia”
    G3 2, 1269-1278 (2012)
  9. Kazama Y., Hirano T., Saito H., Liu Y., Ohbu S., Hayashi Y., and Abe T.:
    “Characterization of highly efficient heavy-ion mutagenesis in Arabidopsis thaliana”
    BMC Plant Biol. 11, 161 (2011).
  10. Kazama Y., Fujiwara M.T., Koizumi A., Nishihara K., Nishiyama R., Kifune E., Abe T., and Kawano S.:
    “A SUPERMAN-like gene is exclusively expressed in female flowers of the dioecious plant Silene latifolia” Plant Cell Physiol. 50, 1127-1141(2009).

 

PageTopへ